توسعه سیستم های multiplex pcr-str جهت آنالیز داده های ژنتیکی جمعیت ایرانی

Authors

داریوش حیدری

d. heydari آزمایشگاه رفرانس سازمان تامین اجتماعی سید حمید غفاری

s.h. ghaffari دانشیار مرکز تحقیقات خون، انکولوژی و پیوند سلول های بنیادی دانشگاه علوم پزشکی تهرانسازمان اصلی تایید شده: سازمان تامین اجتماعی بهرام چهاردولی

b. chahardouli مرکز تحقیقات خون، انکولوژی و پیوند سلول های بنیادی دانشگاه علوم پزشکی تهرانسازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی تهران (tehran university of medical sciences) احمد قره باغیان

a. gh. استاد دانشکده پیراپزشکی دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی ـ مرکز تحقیقات بیماری های مادرزادی خونی کودکان دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتیسازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی تهران (tehran university of medical sciences) کامران علی مقدم

abstract

چکید ه سابقه و هدف تکثیر لکوس های str (توالی های تکرار شونده کوتاه، (short tandem repeats به عنوان یک روش مفید در تعیین هویت انسان به کار می رود. در حال حاضر آنالیز پلی مورفیسم های str نه تنها در پزشکی قانونی و تعیین ابوت بلکه در زمینه های مختلف تشخیص پزشکی شامل ارزیابی وضعیت کایمریسم و بررسی بیماران پس از پیوند آلوژنیک مغز استخوان (bmt) نیز معرفی می گردد. مواد و روش ها در این مطالعه توصیفی، نمونه های خون از 100 نفر از جمعیت ایرانی به صورت تصادفی به دست آمد. به منظور گسترش سیستم های مولتی پلکس str ، ارزیابی فراوانی از نظر نحوه ترکیب و تکثیر لکوس ها انجام گرفت و 3 سیستم تریپلکس str بدون هم پوشانی به دست آمد. تریپلکس ddt شامل لکوس های th01 ، d4s2366 ، d16s539 ؛ تریپلکس vff حاوی لکوس های f13a01 ، fes/fps و vwa و تریپلکس dtc حاوی لکوس های csf1po ، tpox و d13s317 می باشند. یافته ها از اطلاعات آماری رایج، در تعیین ابوت و پزشکی قانونی از قبیل هتروزیگوسیتی( h )، احتمال تشابه دو فرد در یک نمونه جمعیتی( pm )، قدرت تمایز بین افراد یک جمعیت( pd )، قدرت حذف( pe ) و اندیکس ابوت( pi ) و نیز فراوانی آللی برای جمعیت ایرانی با استفاده از هر 3 سیستم مولتی پلکس و لکوس های نماینده شان تعیین شد. برای تمام لکوس ها هیچ انحرافی از معادله هاردی ـ وین برگ دیده نشد. نتیجه گیری گسترش این سیستم های مولتی پلکس str ، باعث ایجاد درجه بالایی از قدرت تمایز (9999999997/0 (pd= و احتمال تشابه دو فرد در یک نمونه جمعیتی( = pm 1 در 109 * 6/3) می گردد که بر کاربردی بودن این سیستم ها در پزشکی قانونی و تعیین هویت انسان تاکید می نماید.

Upgrade to premium to download articles

Already have an account?login

similar resources

توسعه سیستم‌های Multiplex PCR-STR جهت آنالیز داده‌های ژنتیکی جمعیت ایرانی

چکید ه سابقه و هدف تکثیر لکوس‌های STR (توالی‌های تکرار شونده کوتاه، (Short Tandem Repeats به عنوان یک روش مفید در تعیین هویت انسان به کار می‌رود. در حال حاضر آنالیز پلی‌مورفیسم‌های STR نه تنها در پزشکی قانونی و تعیین ابوت بلکه در زمینه‌های مختلف تشخیص پزشکی شامل ارزیابی وضعیت کایمریسم و بررسی بیماران پس از پیوند آلوژنیک مغز استخوان (BMT) نیز معرفی می‌گردد. مواد و روش‌ها در این مطالعه ...

full text

Constructing STR multiplex assays.

Multiplex polymerase chain reaction (PCR) refers to the simultaneous amplification of multiple regions of deoxyribonucleic acid (DNA) using PCR. Commercial short tandem repeat (STR) assays that can coamplify as many as 16 different loci have become widely used in forensic DNA typing. This chapter will focus on some of the aspects of constructing robust STR multiplex assays, including careful de...

full text

آنالیز مولکولی کلاس های مختلف اینتگرون در سویه های بالینی پسودوموناس آئروژینوزا با استفاده از روش Multiplex-PCR

زمینه و هدف: حضور اینتگرون‌های کلاس I، II وIII در پسودوموناس آئروژینوزا با مقاومت دارویی چندگانه، نگرانی‌های فراوانی را در کلینیک ایجاد کرده است. این مطالعه باهدف بررسی فراوانی اینتگرون کلاس I، II و III در ایزوله‌های پسودوموناس آئروژینوزا انجام شد. مواد و روش‌ها: در این مطالعه توصیفی - مقطعی، 60 ایزوله پسودوموناس آئروژینوزا از آزمایشگاه میکروب‌شناسی بیمارستان حضرت رسول (ص)، تهران به دست آمد....

full text

STR-typing of ancient skeletal remains: which multiplex-PCR kit is the best?

AIM To comparatively test nine co mmercially available short tandem repeat (STR)-multiplex kits (PowerPlex 16, 16HS, ES, ESI17, ESX17, S5 [all Promega]; AmpFiSTR Identifiler, NGM and SEfiler [all Applied Biosystems]) for their efficiency and applicability to analyze ancient and thus highly degraded DNA samples. METHODS Fifteen human skeletal remains from the late medieval age were obtained an...

full text

نرم افزار ایرانی ROCSEL؛ اولین نرم افزار آنالیز داده های معمولی و پیش مطالعه آنالیز ویژه مغزه های نفتی

full text

شناسایی ژن های انتروتوکسین استافیلوکوکوس اورئوس با استفاده Multiplex PCR

سابقه و هدف: استافیلوکوکوس اورئوس یکی از مهمترین عوامل مسمومیت غذایی در جهان می باشد. در تحقیقات مختلف مشخص گردیده است که 18-15 درصد سویه های استافیلوکوکوس که از منابع مختلف جدا می شود قادر به تولید انتروتوکسین می باشند که فاکتور اصلی مسمومیت می باشند. هدف از تحقیق حاضر شناسایی ژنهای انتروتوکسین نظیر: (femA،see ،sed ،sec ،seg ،seb، sea) در استافیلوکوکوس اورئوس که با استفاده از روش PCR چندگانه ا...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}

Journal title:

فصلنامه پژوهشی خون

جلد ۱۱، شماره ۴، صفحات ۳۰۶-۳۱۷

Keywords

کلمات کلیدی جمعیت توالی های تکرار شونده کوتاه پزشکی قانونی

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com